Detalhe da pesquisa
1.
Julia for biologists.
Nat Methods
; 20(5): 655-664, 2023 05.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37024649
2.
Array programming with NumPy.
Nature
; 585(7825): 357-362, 2020 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32939066
3.
Squidpy: a scalable framework for spatial omics analysis.
Nat Methods
; 19(2): 171-178, 2022 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35102346
4.
vcfpp: a C++ API for rapid processing of the variant call format.
Bioinformatics
; 40(2)2024 02 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38273677
5.
SimService: a lightweight library for building simulation services in Python.
Bioinformatics
; 40(1)2024 01 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38237907
6.
Cooltools: Enabling high-resolution Hi-C analysis in Python.
PLoS Comput Biol
; 20(5): e1012067, 2024 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38709825
7.
MCell4 with BioNetGen: A Monte Carlo simulator of rule-based reaction-diffusion systems with Python interface.
PLoS Comput Biol
; 20(4): e1011800, 2024 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38656994
8.
No installation required: how WebAssembly is changing scientific computing.
Nature
; 627(8003): 455-456, 2024 Mar.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38467881
9.
ReUseData: an R/Bioconductor tool for reusable and reproducible genomic data management.
BMC Bioinformatics
; 25(1): 8, 2024 Jan 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38172657
10.
cytoviewer: an R/Bioconductor package for interactive visualization and exploration of highly multiplexed imaging data.
BMC Bioinformatics
; 25(1): 9, 2024 Jan 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38172724
11.
Biology System Description Language (BiSDL): a modeling language for the design of multicellular synthetic biological systems.
BMC Bioinformatics
; 25(1): 166, 2024 Apr 25.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38664639
12.
QSIPrep: an integrative platform for preprocessing and reconstructing diffusion MRI data.
Nat Methods
; 18(7): 775-778, 2021 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34155395
13.
Micro-Meta App: an interactive tool for collecting microscopy metadata based on community specifications.
Nat Methods
; 18(12): 1489-1495, 2021 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34862503
14.
OME-NGFF: a next-generation file format for expanding bioimaging data-access strategies.
Nat Methods
; 18(12): 1496-1498, 2021 12.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34845388
15.
Development of interactive biological web applications with R/Shiny.
Brief Bioinform
; 23(1)2022 01 17.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34642739
16.
Gonomics: uniting high performance and readability for genomics with Go.
Bioinformatics
; 39(8)2023 08 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37624924
17.
SBMLDiagrams: a python package to process and visualize SBML layout and render.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36370074
18.
An automated model annotation system (AMAS) for SBML models.
Bioinformatics
; 39(11)2023 11 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37882737
19.
SBML2HYB: a Python interface for SBML compatible hybrid modeling.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36661327
20.
Insane in the vembrane: filtering and transforming VCF/BCF files.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36519840